MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	TCG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520219
2	NC_000868	TC	3	6	177	182	0 %	50 %	0 %	50 %	14520219
3	NC_000868	GGC	2	6	251	256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520219
4	NC_000868	CTT	2	6	383	388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520219
5	NC_000868	GAT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520219
6	NC_000868	TAG	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520219
7	NC_000868	TTATC	2	10	502	511	20 %	60 %	0 %	20 %	14520219
8	NC_000868	GGA	2	6	561	566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520219
9	NC_000868	CTA	2	6	589	594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520219
10	NC_000868	CTT	2	6	611	616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520219
11	NC_000868	CTC	2	6	634	639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
12	NC_000868	GCTT	2	8	648	655	0 %	50 %	25 %	25 %	14520220
13	NC_000868	CAA	2	6	717	722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520220
14	NC_000868	AAC	2	6	751	756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520220
15	NC_000868	TC	3	6	765	770	0 %	50 %	0 %	50 %	14520220
16	NC_000868	CGG	2	6	825	830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520220
17	NC_000868	TCC	2	6	836	841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
18	NC_000868	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520220
19	NC_000868	CTC	2	6	885	890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
20	NC_000868	TCA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520220
21	NC_000868	AATA	2	8	946	953	75 %	25 %	0 %	0 %	14520220
22	NC_000868	AT	3	6	988	993	50 %	50 %	0 %	0 %	14520220
23	NC_000868	TCC	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
24	NC_000868	CCCA	2	8	1081	1088	25 %	0 %	0 %	75 %	14520220
25	NC_000868	TCC	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520221
26	NC_000868	TTA	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520221
27	NC_000868	ATT	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520221
28	NC_000868	CTT	2	6	1184	1189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520221
29	NC_000868	CTC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520221
30	NC_000868	CT	3	6	1260	1265	0 %	50 %	0 %	50 %	14520221
31	NC_000868	TCC	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
32	NC_000868	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520222
33	NC_000868	CCT	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
34	NC_000868	CT	3	6	1655	1660	0 %	50 %	0 %	50 %	14520222
35	NC_000868	ATC	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520222
36	NC_000868	TTA	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520222
37	NC_000868	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520222
38	NC_000868	GAC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520222
39	NC_000868	TCT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520222
40	NC_000868	GGC	2	6	2115	2120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520222
41	NC_000868	TTC	2	6	2121	2126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520222
42	NC_000868	TGA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520222
43	NC_000868	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520222
44	NC_000868	CAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520222
45	NC_000868	CTC	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
46	NC_000868	AT	3	6	2316	2321	50 %	50 %	0 %	0 %	14520222
47	NC_000868	CTA	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520222
48	NC_000868	CTC	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
49	NC_000868	CTC	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
50	NC_000868	ACG	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520222
51	NC_000868	ACT	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520223
52	NC_000868	GAC	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520223
53	NC_000868	CAT	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520223
54	NC_000868	CAAC	2	8	2632	2639	50 %	0 %	0 %	50 %	14520223
55	NC_000868	GAA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520223
56	NC_000868	CTTT	2	8	2653	2660	0 %	75 %	0 %	25 %	14520223
57	NC_000868	TCA	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520223
58	NC_000868	TCT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520223
59	NC_000868	AGGG	2	8	2807	2814	25 %	0 %	75 %	0 %	14520223
60	NC_000868	TCG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520223
61	NC_000868	TTC	2	6	2866	2871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520223
62	NC_000868	CTTCC	2	10	3361	3370	0 %	40 %	0 %	60 %	14520224
63	NC_000868	ACC	3	9	3522	3530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520224
64	NC_000868	TAT	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520224
65	NC_000868	CTC	3	9	3627	3635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520224
66	NC_000868	ATG	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520224
67	NC_000868	AATTGC	2	12	3771	3782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14520224
68	NC_000868	C	6	6	3815	3820	0 %	0 %	0 %	100 %	14520224
69	NC_000868	TGCT	2	8	3859	3866	0 %	50 %	25 %	25 %	14520224
70	NC_000868	GTT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520224
71	NC_000868	TAA	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520224
72	NC_000868	TCGT	2	8	3958	3965	0 %	50 %	25 %	25 %	14520224
73	NC_000868	CTT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520224
74	NC_000868	GGA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
75	NC_000868	AG	4	8	4274	4281	50 %	0 %	50 %	0 %	14520225
76	NC_000868	GA	3	6	4359	4364	50 %	0 %	50 %	0 %	14520225
77	NC_000868	AGA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520225
78	NC_000868	TAA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520225
79	NC_000868	CTTT	2	8	4517	4524	0 %	75 %	0 %	25 %	14520225
80	NC_000868	GGC	2	6	4567	4572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520225
81	NC_000868	G	6	6	4586	4591	0 %	0 %	100 %	0 %	14520225
82	NC_000868	TAA	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520225
83	NC_000868	ATT	2	6	4639	4644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520225
84	NC_000868	AG	3	6	4665	4670	50 %	0 %	50 %	0 %	14520225
85	NC_000868	GGA	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
86	NC_000868	AGG	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
87	NC_000868	TGA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520225
88	NC_000868	AGG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
89	NC_000868	ACCTC	2	10	5931	5940	20 %	20 %	0 %	60 %	14520226
90	NC_000868	CTAT	2	8	5997	6004	25 %	50 %	0 %	25 %	14520226
91	NC_000868	CT	3	6	6068	6073	0 %	50 %	0 %	50 %	14520226
92	NC_000868	AGA	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520227
93	NC_000868	GGAAA	2	10	6495	6504	60 %	0 %	40 %	0 %	14520227
94	NC_000868	CTAT	2	8	6661	6668	25 %	50 %	0 %	25 %	14520227
95	NC_000868	CAG	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520227
96	NC_000868	TAG	2	6	6727	6732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520227
97	NC_000868	CCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520227
98	NC_000868	AG	3	6	6779	6784	50 %	0 %	50 %	0 %	14520227
99	NC_000868	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520227
100	NC_000868	TAG	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520227
101	NC_000868	CTA	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520227
102	NC_000868	GAA	3	9	6885	6893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520227
103	NC_000868	CTG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520227
104	NC_000868	AGG	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520227
105	NC_000868	TTC	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
106	NC_000868	GAGT	2	8	7064	7071	25 %	25 %	50 %	0 %	14520228
107	NC_000868	TTC	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
108	NC_000868	ATT	2	6	7123	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520228
109	NC_000868	TGT	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520228
110	NC_000868	CAA	2	6	7299	7304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520228
111	NC_000868	CTT	2	6	7331	7336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
112	NC_000868	TTA	2	6	7377	7382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520228
113	NC_000868	TATC	2	8	7443	7450	25 %	50 %	0 %	25 %	14520228
114	NC_000868	AAG	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520228
115	NC_000868	CT	3	6	7500	7505	0 %	50 %	0 %	50 %	14520228
116	NC_000868	TCC	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520228
117	NC_000868	CTT	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
118	NC_000868	ACGCTA	2	12	7664	7675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	14520228
119	NC_000868	CCT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520228
120	NC_000868	TAT	2	6	7741	7746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520228
121	NC_000868	CTCG	2	8	7783	7790	0 %	25 %	25 %	50 %	14520228
122	NC_000868	TCC	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520228
123	NC_000868	TTC	2	6	7900	7905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
124	NC_000868	TAT	2	6	8002	8007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520229
125	NC_000868	AGG	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520229
126	NC_000868	ATT	2	6	8039	8044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520229
127	NC_000868	CTC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520229
128	NC_000868	ACCC	2	8	8210	8217	25 %	0 %	0 %	75 %	14520229
129	NC_000868	CTT	2	6	8251	8256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
130	NC_000868	TCG	2	6	8297	8302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520229
131	NC_000868	CTT	2	6	8314	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
132	NC_000868	CTT	2	6	8428	8433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
133	NC_000868	ATC	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520229
134	NC_000868	ATC	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520229
135	NC_000868	CT	3	6	8676	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	14520230
136	NC_000868	CTC	2	6	8688	8693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520230
137	NC_000868	CTGG	2	8	8805	8812	0 %	25 %	50 %	25 %	14520230
138	NC_000868	CTT	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
139	NC_000868	CTT	2	6	8837	8842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
140	NC_000868	TAT	2	6	8927	8932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520230
141	NC_000868	CTT	2	6	8999	9004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
142	NC_000868	TGG	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520230
143	NC_000868	CTT	2	6	9077	9082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
144	NC_000868	ACG	2	6	9135	9140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520230
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146	NC_000868	TAT	2	6	9272	9277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520230
147	NC_000868	CCT	2	6	9317	9322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520230
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151	NC_000868	GTA	2	6	9689	9694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520231
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157	NC_000868	CTA	2	6	10069	10074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520231
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159	NC_000868	TCT	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520231
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161	NC_000868	GAA	2	6	10214	10219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520231
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164	NC_000868	TTA	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520231
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169	NC_000868	GAAAG	2	10	10671	10680	60 %	0 %	40 %	0 %	14520231
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173	NC_000868	CCT	2	6	10878	10883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520232
174	NC_000868	CT	3	6	10900	10905	0 %	50 %	0 %	50 %	14520232
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179	NC_000868	AG	3	6	10999	11004	50 %	0 %	50 %	0 %	14520232
180	NC_000868	CTC	2	6	11099	11104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520232
181	NC_000868	TTGC	2	8	11173	11180	0 %	50 %	25 %	25 %	14520232
182	NC_000868	AGA	2	6	11255	11260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520232
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188	NC_000868	AGGT	2	8	11542	11549	25 %	25 %	50 %	0 %	14520232
189	NC_000868	CCTA	2	8	11553	11560	25 %	25 %	0 %	50 %	14520232
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191	NC_000868	CCCT	2	8	11892	11899	0 %	25 %	0 %	75 %	14520232
192	NC_000868	AAC	2	6	11979	11984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520232
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249	NC_000868	GGC	2	6	14911	14916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520235
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254	NC_000868	TGA	2	6	15189	15194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520235
255	NC_000868	CGA	2	6	15228	15233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520235
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257	NC_000868	TCCTC	2	10	15258	15267	0 %	40 %	0 %	60 %	14520235
258	NC_000868	CTT	2	6	15364	15369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520235
259	NC_000868	AGT	2	6	15405	15410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520235
260	NC_000868	CCT	2	6	15462	15467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520235
261	NC_000868	TCT	2	6	15495	15500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520235
262	NC_000868	CCT	2	6	15501	15506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520235
263	NC_000868	GCT	2	6	15525	15530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520235
264	NC_000868	TCGGTC	2	12	15557	15568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520235
265	NC_000868	TGA	2	6	15669	15674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520235
266	NC_000868	CCTT	2	8	15698	15705	0 %	50 %	0 %	50 %	14520235
267	NC_000868	TGT	2	6	15720	15725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520235
268	NC_000868	TC	4	8	15803	15810	0 %	50 %	0 %	50 %	14520235
269	NC_000868	CTC	3	9	15808	15816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520235
270	NC_000868	GAG	2	6	15853	15858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520235
271	NC_000868	CCT	2	6	15861	15866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520235
272	NC_000868	TGA	2	6	15942	15947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520235
273	NC_000868	TTC	2	6	15979	15984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520235
274	NC_000868	CTT	2	6	15988	15993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520235
275	NC_000868	CCT	2	6	16041	16046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520235
276	NC_000868	CAT	2	6	16072	16077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520235
277	NC_000868	TCG	2	6	16106	16111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520235
278	NC_000868	TCGT	2	8	16127	16134	0 %	50 %	25 %	25 %	14520235
279	NC_000868	GTC	2	6	16193	16198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520235
280	NC_000868	TAT	2	6	16213	16218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520235
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282	NC_000868	GAA	2	6	16473	16478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520236
283	NC_000868	TGA	2	6	16815	16820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520236
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288	NC_000868	AAG	2	6	17189	17194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520236
289	NC_000868	AGA	2	6	17197	17202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520236
290	NC_000868	ATT	2	6	17292	17297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520237
291	NC_000868	CTC	2	6	17324	17329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520237
292	NC_000868	TCT	2	6	17359	17364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520237
293	NC_000868	GAG	2	6	17378	17383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520237
294	NC_000868	GGA	2	6	17415	17420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520237
295	NC_000868	T	7	7	17617	17623	0 %	100 %	0 %	0 %	14520237
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298	NC_000868	TCA	2	6	17725	17730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520238
299	NC_000868	ACT	2	6	17875	17880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520238
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301	NC_000868	TG	3	6	17948	17953	0 %	50 %	50 %	0 %	14520238
302	NC_000868	ATTG	2	8	18003	18010	25 %	50 %	25 %	0 %	14520238
303	NC_000868	AAG	2	6	18113	18118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520239
304	NC_000868	TCT	2	6	18184	18189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520239
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311	NC_000868	CTCC	2	8	18594	18601	0 %	25 %	0 %	75 %	14520239
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347	NC_000868	TCCT	2	8	20263	20270	0 %	50 %	0 %	50 %	14520240
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379	NC_000868	AATGG	2	10	22449	22458	40 %	20 %	40 %	0 %	14520242
380	NC_000868	CGG	2	6	22549	22554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520242
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383	NC_000868	TAT	2	6	22739	22744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520242
384	NC_000868	AT	3	6	22912	22917	50 %	50 %	0 %	0 %	14520243
385	NC_000868	GAC	2	6	23005	23010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520243
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387	NC_000868	ATC	2	6	23153	23158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520243
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390	NC_000868	TTAT	2	8	23303	23310	25 %	75 %	0 %	0 %	14520243
391	NC_000868	CCT	2	6	23533	23538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520243
392	NC_000868	TAAA	2	8	23578	23585	75 %	25 %	0 %	0 %	14520243
393	NC_000868	GAA	2	6	23611	23616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520243
394	NC_000868	AGG	2	6	23645	23650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520243
395	NC_000868	CTC	2	6	23725	23730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520244
396	NC_000868	CT	3	6	23827	23832	0 %	50 %	0 %	50 %	14520244
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